شکارچیان انگلیس در سطح جهان در حال مسابقه برای جلوتر از COVID هستند


لندن (AP) – در 4 مارس 2020 ، هنگامی که فقط 84 مورد تایید شده COVID-19 در انگلیس وجود داشت ، پروفسور شارون پیاکو اذعان کرد که این کشور باید ظرفیت خود را برای تجزیه و تحلیل ترکیب ژنتیکی ویروس گسترش دهد.

یک میکروبیولوژیست از دانشگاه کمبریج درک می کند که تعیین توالی ژنومی در نظارت بر بیماری ، کنترل شیوع و تولید واکسن بسیار مهم است. بنابراین او شروع به کار با همکاران خود از سراسر کشور کرد تا طرحی را ارائه دهد. ظرف یک ماه ، دولت 20 میلیون پوند (28 میلیون دلار) برای تأمین اعتبار کار آنها تأمین کرد.

این ابتکار به انگلستان کمک کرده است تا در تحلیل سریع مواد ژنتیکی ناشی از تعداد زیادی از عفونت های COVID-19 به یک رهبر جهانی تبدیل شود و بیش از 40٪ توالی ژنومی شناسایی شده تاکنون تولید کند. امروزه ، اولویت اصلی آنها یافتن انواع جدیدتر است که در برابر واکسن ها خطرناک تر یا مقاوم تر باشند ، اطلاعاتی که در کمک به محققان برای اصلاح واکسن ها یا تولید واکسن های جدید برای مبارزه با ویروس همیشه در حال تغییر بسیار مهم است.

دکتر اریک توپول ، رئیس پزشکی نوآور در Scripps Research در سن دیگو ، کالیفرنیا ، گفت: “آنها به جهانیان نشان دادند که چگونه این کار را انجام دهند.”

تعیین توالی ژنومی اساساً فرآیند نقشه برداری از ترکیب ژنتیکی منحصر به فرد موجودات زنده است – در این حالت ویروسی که باعث ایجاد COVID-19 می شود. در حالی که این تکنیک توسط محققان برای بررسی موارد مختلف از سرطان گرفته تا مسمومیت غذایی و شیوع آنفولانزا مورد استفاده قرار گرفته است ، این اولین باری است که مقامات از آن برای تهیه نظارت بر همه گیر جهانی در زمان واقعی استفاده می کنند.

پیکاک ، 62 ساله ، به عنوان مدیرعامل و رئیس کنسرسیوم انگلیس COVID-19 UK ، گروهی که یک سال پیش به آن کمک کرد ، تلاش های انگلیس برای ثبات را رهبری می کند.


طبق گزارش های هفتگی در وب سایت گروه ، در هفته اول این ماه ، COG-UK 13171 ویروس را توالی داد ، این در حالی است که در 12 روز اول عملیات در مارس سال گذشته ، 260 ویروس بود.

پشت این رشد سیستمی قرار دارد که علم توالی ژنومی را به منابع سیستم ملی بهداشت انگلیس پیوند می دهد.

آزمایشات مثبت COVID-19 از بیمارستان ها و برنامه های آزمایش جامعه در سراسر کشور به شبکه ای از 17 آزمایشگاه ارسال می شود که در آن دانشمندان روزهای خود را صرف استخراج مواد ژنتیکی از هر سواب و تجزیه و تحلیل آن می کنند تا کد ژنتیکی منحصر به فرد ویروس را شناسایی کنند. سپس توالی ها به داده های بهداشت عمومی ارجاع داده می شوند تا بهتر درک کنند که چگونه ، کجا و چرا COVID-19 توزیع می شود.

هنگامی که جهش در ویروس با افزایش غیرقابل توجیه موارد مطابقت داشته باشد ، این نشانه ای است که نوع جدیدی از اضطراب در منطقه در گردش است.

اهمیت توالی ژنومی در اواخر سال گذشته با افزایش تعداد عفونت های جدید در جنوب شرقی انگلیس آشکار شد. با افزایش موارد با وجود محدودیت های شدید محلی ، مقامات بهداشت عمومی شروع به کار کردند تا دلیل آن را بفهمند.

محققان با ترکیب داده های تعیین توالی ژنوم ، نوع جدیدی را شناسایی کردند که شامل تعدادی جهش است که پرش ویروس از یک شخص به شخص دیگر را آسان می کند.

نخست وزیر بوریس جانسون که مجهز به این اطلاعات بود ، قفل ملی را وضع کرد و استراتژی محدودیت های محلی را که شامل نسخه جدید نشد ، از بین برد.

پیکاک گفت ، تحریک علمی بسیار مهم است ، اما مانند جستجوی سوزن در انبار کاه است ، زیرا محققان مجبورند توالی ژنتیکی هزاران نوع بی خطر را برای یافتن موارد نادر غربال کنند.

وی گفت: “این كه بتوانیم بفهمیم چه گزینه هایی چه در انگلیس و چه در سرتاسر جهان در حال چرخش است ، و از این رو پیامدهای تولید واكسن و چگونگی نیاز به سازگاری واكسن ها امری حیاتی است.”

این تلاش یک همکاری جهانی است و بیش از 120 کشور توالی را به GISAID ارسال می کنند ، یک مرکز اشتراک داده که در ابتدا برای ردیابی ویروس های آنفلوانزا ایجاد شده است.

ایسلند ، استرالیا ، نیوزیلند و دانمارک در حقیقت موارد COVID-19 خود را بیشتر از انگلیس دارند و دانمارک کار را سریعتر انجام می دهد. اما کار COG-UK ، همراه با اندازه انگلستان و تعداد زیاد موارد ، آن را به یک رهبر جهانی در دنباله COVID-19 تبدیل کرد. انگلستان 379،294 از تقریبا 898،000 توالی موجود در پایگاه داده GISAID را ارائه داد.

ماد آلبرتسن ، استاد دانشگاه دانمارک آلبورگ ، که بخشی از تلاش های توالی یابی ژنومی است ، گفت: این کار سود حتی برای کشورهای پیشرفته مانند دانمارک ، جایی که دانشمندان از ابزار توسعه یافته در انگلیس برای تجزیه و تحلیل داده های خود استفاده می کنند ، سودآور است.

آلبرتسن گفت: “آنچه انگلیس به بهترین نحو انجام داده است ، تنظیمات كلی است.” “بنابراین آنها محققان بسیار بیشتری و ساختار بسیار حرفه ای تری در مورد نحوه استفاده از داده ها دارند.”

Topol از تحقیقات اسکریپس گفت ، ایالات متحده همچنین در تلاش است تا از انگلیس بیاموزد زیرا دولت بایدن سیاست های ضد علمی سلف خود را تغییر می دهد ، که این امر تلاش های کشور برای ثبات را کند می کند. نمایندگان COG-UK در گفتگوی اخیر با محققان آمریکایی و بنیاد راکفلر با هدف ایجاد ظرفیت در ایالات متحده شرکت کردند.

توپول گفت: “آنها با هزینه طاووس و خدمه فقط در سكانس متوقف نشدند.” “آنها آزمایشگاه هایی را برای انجام این کار دیگر سازمان دادند ، که در واقع یک ارزیابی آزمایشگاهی بسیار فشرده است. و پس از آن ارزیابی اپیدمیولوژیک وجود دارد. می دانید که باید همه چیز را روی هر استوانه شلیک کنید. مثل ماشین 12 سیلندر است. همه آنها برای حرکت باید شلیک کنند. “

موفقیت انگلیس در تعیین توالی مبتنی بر دانش پیشگام ژنتیک در انگلیس است که قدمت آن به کارهای جیمز واتسون ، فرانسیس کریک و روزالیند فرانکلین برمی گردد که به دلیل کشف ساختار شیمیایی DNA اعتبار داشتند. سایر دانشمندان انگلیسی تکنیک های تعیین توالی اولیه و بعداً فناوری های جدید را ایجاد کردند که باعث کاهش زمان و هزینه های توالی شد.

این موفقیت باعث سرمایه گذاری شد ، مانند تصمیم Wellcome Trust در سال 1992 برای ایجاد مرکز Sanger برای کمک به نقشه برداری از ژنوم انسان ، و گسترش دامنه تخصص انگلستان. و سرویس بهداشت ملی انگلیس اطلاعات تحقیقاتی زیادی را در اختیار محققان قرار داد.

هنوز همكاران مي گويند كه طاووس شخصاً سزاوار اعتبار زيادي براي موفقيت COG-UK است ، اگرچه او ترجيح مي دهد كه بر كار ديگران تأكيد كند.

او که به شدت سازمان دهنده خوبی بود ، کارآگاهان DNA ملت را از طریق حسن نیت و اتاق گفتگو کور کرد. اندرو پیج ، متخصص تجزیه و تحلیل رایانه ژنومیك پاتوژن رایانه ای كه با COG-UK كار می كند ، گفت كه بخشی از این ترفند ترغیب دانشمندان برجسته است كه منافع و رقابت علمی خود را كنار بگذارند تا با هم برای مقابله با بیماری همه گیر كار كنند.

کار طاووس در این پروژه باعث شهرت وی و لقب گزینه اصلی شکارچی شده است. اما او اصطلاح ساده تری را ترجیح می دهد.

وی گفت: “من قبل از هر چیز خود را دانشمندی می دانم که در تلاش است تا به مردم انگلیس و سایر کشورها کمک کند تا همه گیری را کنترل کنند.” “ممکن است عبارت بهتری برای این وجود داشته باشد ، اما دانشمند این کار را انجام خواهد داد.”

___

پوشش AP Coronavirus Pandemic را دنبال کنید:

https://apnews.com/hub/coronavirus-pandemic

https://apnews.com/hub/coronavirus- واکسن

https://apnews.com/UnderstandingtheOutbreak


منبع: khabar-khanoma.ir

دیدگاهتان را بنویسید

Comment
Name*
Mail*
Website*